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上海交大SJTU-BioX-Shanghai队再获iGEM国际基因工程机器大赛金牌
( 发布时间:2019-11-06 点击次数:1076 )

北京时间11 月 5 日凌晨,为期5天的2019年合成生物学领域国际顶尖赛事——国际基因工程机器大赛(International Genetically Engineered Machine Competition,以下简称为iGEM)在美国波士顿的海因斯会议中心落下帷幕,全球 375 支队伍共襄盛举。上海交通大学代表队SJTU-BioX-Shanghai凭借“CRISPR脱靶检测与存储项目成功摘金,并获得最佳创新应用项目提名奖,再一次展现了交大学子的实力和风采!

 

今年的参赛项目运用合成生物学方法,针对当前CRISPR技术的瓶颈——脱靶问题,提出了新的解决方案。与以往降低脱靶概率和依赖测序检测是否脱靶不同,SJTU-BioX-Shanghai另辟蹊径,通过数学建模从基因组中筛选出具有潜在脱靶概率的非目标序列,以此作为“诱饵”,构建了转录激活、实时检测、生物存储这三个层次的模块化装置,为DNA编辑中的脱靶效应提供了快速和经济实惠的检测方案。同时,为解决生物存储可能存在的信息丢失及错译的问题,队员们借用二维码原理,开发出适用于生物存储编码和解译的软件。项目立题角度新颖,可行性强,与基因编辑前沿热点联系紧密,为快速检测脱靶提供了具有启发性的研究思路,具有良好的应用潜力,因此获得了iGEM评委的一致肯定和充分赞扬。

脱靶(诱饵)序列的预测,脱靶实时监测及CRISPR存储系统

 

另外,团队还扩展了项目的外延,提出了普适于所有 iGEM 团队的新模型L-M-P-H-E,为今后项目Human Practices 制定新的思路与标准。队员们从实验室出发,结合市场探究项目设计的生物存储的利弊、探索未来应用的无限可能,从公众、人文分析人们对于基因编辑的态度,最后整合四个角度,将思索糅合进书本,用支教的方式普及合成生物学,做到项目来源于社会,走进社会。

SJTU-BioX-Shanghai团队依托于Bio-X研究院“合成基因机器学生科技创新工作室”,指导老师为贺林院士、马钢副教授和王毓舒老师,2019年团队由包括王娅、蒋时枫、杨雨晴、孙健乐、朱宸、李可依、陈凤舞(生命科学技术学院),王韵晴、姜梦琦、杨晓尘、王丹舒(医学院),周锐鑫、周皓文(致远学院)等在内的15名本科生组成。往届队员钟博子韬、何沛祥、刘致祥担任了团队顾问。      

从2009到2018的十年间,SJTU-BioX-Shanghai收获九金一铜的佳绩,并曾荣获亚洲冠军、最佳人工生物模块设计、全球最佳16队、最佳医学诊断项目提名等殊荣。2019 届队员秉承“精勤、力行、求真、务实”的奋斗精神,实现了实验、建模、设计、社会的交互融合,在前沿生物学的世界舞台上再一次捍卫了交大荣誉。不忘初心,牢记使命,Bio-X研究院也将始终坚持和贯彻以学生为主体的创新教育和培训模式,为中国的科技创新与发展输出高素质人才而不懈努力!

在此也特别感谢校团委,生命学院,上海浦东解码生命科学研究院对我们团队的大力支持和赞助!

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