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创新组

 

师咏勇
博士, 长江学者特聘教授, 国家杰出青年基金获得者, 课题组长,博导

学    士 (1997-2001) 上海交通大学
博    士 (2001-2006) 上海交通大学
Email: shiyongyong@gmail.com

 

个人介绍:
          教育部长江学者特聘教授,国家杰出青年基金获得者,中组部青年拔尖人才,教育部新世纪优秀人才,上海市青年科技英才,上海市科技启明星,全国优秀博士论文获得者;国家自然科学基金重点项目、国家863计划重大项目等课题负责人;中国遗传学会青年委员会委员,上海市遗传学会理事,Experimental Biology and Medicine杂志编委;发表SCI论文100余篇,总影响因子超过1000,总他引2000余次。

 

研究方向

          课题组主要研究方向为疾病、行为等人类复杂性状的遗传学研究,涉及分子遗传学、生物信息学、纳米科学、发育生物学等领域。

 
代表性论文:

1.Chen P, Pan D, Fan C*, Chen J, Huang K, Wang D, Zhang H, Li Y, Feng G, Liang P, He L, Shi Y*. Gold nanoparticles for high-throughput genotyping of long-range haplotypes. Nature Nanotechnology. 2011 Sep 4;6(10):639-44. doi: 10.1038/nnano.2011.141. (IF: 30.324)


2. Shi Y*, Li L, Hu Z, Li S, Wang S, Liu J, Wu C, He L, Zhou J, Li Z, Hu T, Chen Y, Jia Y, Wang S, Wu L, Cheng X, Yang Z, Yang R, Li X, Huang K, Zhang Q, Zhou H, Tang F, Chen Z, Shen J, Jiang J, Ding H, Xing H, Zhang S, Qu P, Song X, Lin Z, Deng D, Xi L, Lv W, Han X, Tao G, Yan L, Han Z, Li Z, Miao X, Pan S, Shen Y, Wang H, Liu D, Gong E, Li Z, Zhou L, Luan X, Wang C, Song Q, Wu S, Xu H, Shen J, Qiang F, Ma G, Liu L, Chen X, Liu J, Wu J, Shen Y, Wen Y, Chu M, Yu J, Hu X, Fan Y, He H, Jiang Y, Lei Z, Liu C, Chen J, Zhang Y, Yi C, Chen S, Li W, Wang D, Wang Z, Di W, Shen K, Lin D, Shen H, Feng Y, Xie X*, Ma D*. A genome-wide association study identifies two new cervical cancer susceptibility loci at 4q12 and 17q12. Nature Genetics. 2013 Aug;45(8):918-22. doi: 10.1038/ng.2687. Epub 2013 Jun 30. (IF: 36.377)
 

3.Shi Y*, Hu Z, Wu C, Dai J, Li H, Dong J, Wang M, Miao X, Zhou Y, Lu F, Zhang H, Hu L, Jiang Y, Li Z, Chu M, Ma H, Chen J, Jin G, Tan W, Wu T, Zhang Z, Lin D*, Shen H*. A genome-wide association study identifies new susceptibility loci for non-cardia gastric cancer at 3q13.31 and 5p13.1. Nature Genetics. 2011 Oct 30;43(12):1215-8. doi: 10.1038/ng.978. (IF: 36.377)
 

4.Shi Y*, Li Z, Xu Q, Wang T, Li T, Shen J, Zhang F, Chen J, Zhou G, Ji W, Li B, Xu Y, Liu D, Wang P, Yang P, Liu B, Sun W, Wan C, Qin S, He G, Steinberg S, Cichon S, Werge T, Sigurdsson E, Tosato S, Palotie A, Nöthen MM, Rietschel M, Ophoff RA, Collier DA, Rujescu D, Clair DS, Stefansson H, Stefansson K, Ji J, Wang Q, Li W, Zheng L, Zhang H, Feng G, He L*. Common variants on 8p12 and 1q24.2 confer risk of schizophrenia. Nature Genetics. 2011 Oct 30;43(12):1224-7. doi: 10.1038/ng.980. (IF: 36.377)
 

5.Shi Y, Zhao H, Shi Y, Cao Y, Yang D, Li Z, Zhang B, Liang X, Li T, Chen J, Shen J, Zhao J, You L, Gao X, Zhu D, Zhao X, Yan Y, Qin Y, Li W, Yan J, Wang Q, Zhao J, Geng L, Ma J, Zhao Y, He G, Zhang A, Zou S, Yang A, Liu J, Li W, Li B, Wan C, Qin Y, Shi J, Yang J, Jiang H, Xu JE, Qi X, Sun Y, Zhang Y, Hao C, Ju X, Zhao D, Ren CE, Li X, Zhang W, Zhang Y, Zhang J, Wu D, Zhang C, He L*, Chen ZJ*. Genome-wide association study identifies eight new risk loci for polycystic ovary syndrome. Nature Genetics. 2012 Aug 12. doi: 10.1038/ng.2384. [Epub ahead of print] (IF: 36.377)
 

6.Li J, Zhou G, Ji W, Feng G, Zhao Q, Liu J, Li T, Li Y, Chen P, Zeng Z, Wang T, Hu Z, Zheng L, Wang Y, Shen Y, He L, Shi Y*. Common Variants in the BCL9 Gene Conferring Risk of Schizophrenia. Archives of General Psychiatry. 2011 Mar;68(3):232-40. (IF: 15.618)

 

7. Zeng Z, Wang T, Li T, Li Y, Chen P, Zhao Q, Liu J, Li J, Feng G, He L, Shi Y*. Common SNPs and haplotypes in DGKH are associated with bipolar disorder and schizophrenia in the Chinese Han population. Molecular Psychiatry. 2011 May;16(5):473-5. (IF: 15.470)
 

8.Chen ZJ*, Zhao H, He L, Shi Y, Qin Y, Shi Y*, Li Z, You L, Zhao J, Liu J, Liang X, Zhao X, Zhao J, Sun Y, Zhang B, Jiang H, Zhao D, Bian Y, Gao X, Geng L, Li Y, Zhu D, Sun X, Xu JE, Hao C, Ren CE, Zhang Y, Chen S, Zhang W, Yang A, Yan J, Li Y, Ma J, Zhao Y. Genome-wide association study identifies susceptibility loci for polycystic ovary syndrome on chromosome 2p16.3, 2p21 and 9q33.3. Nature Genetics. 2011 Jan;43(1):55-9. (IF: 36.377)

 

9.Hu Z*, Liu Y, Zhai X, Dai J, Jin G, Wang L, Zhu L, Yang Y, Liu J, Chu M, Wen J, Xie K, Du G, Wang Q, Zhou Y, Cao M, Liu L, He Y, Wang Y, Zhou G, Jia W, Lu J, Li S, Liu J, Yang H, Shi Y*, Zhou W*, Shen H*. New loci associated with chronic hepatitis B virus infection in Han Chinese. Nature Genetics. 2013 Oct 27. doi: 10.1038/ng.2809. [Epub ahead of print] (IF: 36.377)

 

10. Shi YY*, He G*, Zhang Z, Tang W, Zhang J, Zhao Q, Zhang J, Li XW, Xi ZR, Fang C, Zhao XZ, Feng GY, He L*. A study of rare structural variants in schizophrenia patients and normal controls from Chinese Han population. Molecular Psychiatry. 2008 Oct;13(10):911-3. (IF: 15.470)

 

 

#并列第一作者 *通讯作者

 

 

 

 

 

潘  敦
博士,副研究员,硕导        

学    士 (1996-2000) 北京理工大学
博    士 (2000-2005) 中科院理化技术研究所
Email: pandun@sjtu.edu.cn

 

个人介绍:
         主要研究方向纳米分子生物学,纳米生物检测,纳米遗传学等方面,累计发表论文30余篇,其中多篇代表性文章发表在Nature Nanotechnology, J. Am. Chem. Soc., Adv. Mater., Small,Scientific Reports等国际著名杂志。承担课题包括国家自然科学基金三项,国家重大研究计划(973)一项(子课题负责人),国家重大研究计划(973)一项(研究骨干)

研究方向

        主要研究方向纳米分子生物学,纳米生物检测,纳米遗传学等方面。

 
代表性论文:

1. Chen P, Pan D, Fan CH, et. al. (2011) Nature Nanotechnol., 6, 639-644. (IF=34.048,)

 

2. Lu WW., Wang LH., Li J., Zhao Y.,  Zhou Z., Shi JY., Zuo XL., Pan D (2015) Sci. Rep., 5, 10158. (IF=5.578, 通讯作者)

 

3. Pan D, Mi LJ, Huang Q, et.al. (2012) Integrative biology, 4,1155-1164. (IF=3.756)

 

4. Pan D, Wen YQ, Mi LJ, et.al. (2011) Current Organic Chemistry, 15, 486-497. (IF=2.157)

 

5. Wang FY, Zhu Y, Zhou L, Pan L, Cui ZF, Fei Q, Luo SH, Pan D, et. al. (2015) Angewandte Chemie International Edition, 54, 7349-7353. (IF=11.261)

 

6. Pei H, Zuo XL, Pan D, et. al. (2013) NPG Asia Materials, 5, e51. (IF=10.118)

 

7. Zhang HL, Chao J, Pan D, et.al. (2012) Chemical Communication, 48, 6405-6407. (IF= 6.834)

 

#并列第一作者 *通讯作者

 

王  卓
博士,  副教授,硕导

学    士 (1996-2000) 哈尔滨理工大学
硕    士 (2000-2003) 哈尔滨理工大学

博    士 (2003-2006) 上海交通大学
博士后 (2013-2014) 美国西雅图系统生物学研究所(ISB)

Email: zhuowang@sjtu.edu.cn

 

个人介绍:
          主要从事生物信息学和系统生物学方面的研究,利用数理建模等方法处理生物医学大数据,揭示生物系统的代谢调控过程及疾病机理,近年来发表SCI论文20余篇。主持国家自然基金、上海市自然基金、教育部留学回国人员基金等,作为骨干参与科技部863、精准医学重点专项、上海市重大基础项目等多项研究。International Journal of Bioinformatics & Biological Systems等期刊编委。荣获上海交大SMC晨星优秀青年学者奖励,交大烛光优秀教师二等奖和教学新秀提名奖。

 

研究方向

           

1.高通量测序数据分析与多组学整合

2.基于机器学习和统计方法识别致病基因和药物靶标

3.基于代谢网络指导合成生物学设计

 
代表性论文:
 
1. Wang Z, Danziger S, Heavner B, Ma SY, Smith J, Li S, Baliga N, Aitchison J, Price N.PLoS Computational Biology, In press.bioRxiv doi:10.1101/087148.

 

2. Wang Z, Lu LY, Liu L, Li J. Metabolomics (Los Angel) 2017, 7: 192. doi:10.4172/2153-0769.1000192.

 

3. Shen FZ, Li J, Zhu Y, Wang Z*. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2016, (4) 5: 1644001.

 

4. Liu L, Shen FZ, Xin CP, Wang Z*. Journal of Integrative Plant Biology. 2015, 12370.

 

5. Wang CL, Guo LY, Li YX, Wang Z*. BMC Systems Biology, 2012, 6: S9.

 

6. Wang J, Wang Y, Liu L, Wang Z*, Zhu XG*,Ma XT*. BMC Evolutionary Biology, 2011, 11:161.

 

7. Chang X, Wang Z, Hao P, Li YY, Li YX. Genomics, 2010, 95: 339–344.

 

8. Wang Z, Zhu XG, Chen YZ, Li YX, Liu L. Journal of Evolutionary Biology, 2009, 22(1): 71-79.

 

#并列第一作者 *通讯作者

 

 

 

 

 

 

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